由于脓肿发生的位置不同,临床表现也不尽相同。但一般的症状是，当发现肛门直肠周围有一个小硬块或肿块，继则突然局部出现剧烈疼痛难忍、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、里急后重、大便秘结、排尿不畅，有直肠刺激症状。并随之出现如体温升高、食欲不振、寒战、神疲乏力等全身中毒症状。一般1 周左右即可形成脓肿，在肛门周围或直肠内指诊可以触到波动、柔软的脓腔。此时用注射器穿刺可抽出脓液。如行切开排脓处理，或自溃流脓后，局部疼痛等症状就会缓解或消失，体温下降，全身情况改善。上述是细菌感染引起肛门直肠周围脓肿的主要症状。

结核性肛门直肠周围脓肿的临床表现常常是慢性发病，脓肿经数周或数月才能形成、局部疼痛不剧烈，伴有低热，破溃后流出的脓液呈清稀乳白色，脓口凹陷，常有多个流脓的外口，经久不愈。全身检查可找到结核病灶，脓液培养可发现结核杆菌。

对于肛周脓肿的治疗，东大肛肠医院采用HCPT微创术治疗，可以通过一次性手术治疗，避免了传统疗法要进行两次手术的弊端，大大缩短了患者康复时间，减少了患者痛苦。手术时，该院专家借助先进的探针配合双氧水灌注的方法，准确找到全部内口，有效避免漏诊、漏治。一反传统手术将瘘管全部挑开的方式，以微创的小切口，只对主灶切开，对口引流，对内口和外口分解处理，部分切开部分保留，化复杂为单纯，在治疗疾病的同时，不损伤肛门功能，将手术创口至少缩小了三分之二，大程度减少了对机体的损害。